L’église du XIVe siècle ayant été démolie pour dégager la citadelle en 1639, un nouvel édifice voit le jour en 1677. La nef unique comporte cinq travées flanquées de chapelles latérales. Son décor actuel a été mis en place au XIXe siècle. La chapelle des Saintes-Épines, dont la confrérie existe toujours, conserve quatre épines de la couronne du Christ. Cette précieuse relique, acquise par saint Louis, fut léguée à son fils Philippe le Hardi, mort à Perpignan en 1285. Le groupe monumental de saint Matthieu et l'ange, daté de 1803, œuvre du sculpteur François Boher, est placé dans le maître-autel.